溫度對殺菌滅藻劑殺菌效果，有幾種方法︰當溫度升高時，增加細胞細胞質膜透性的微生物，或甚至損害膜，使它更容易殺菌劑進入網站的行動;

溫度上升，殺菌滅藻劑，傳播速度更快和迅速穿過屏障的穿透能力和達到網站的行動;

溫度有利于在對細菌和加速殺菌功效的發揮與代謝的中間產物殺菌滅藻劑生化反應的影響。已經證明，苯酚在沙門氏菌甲型副傷寒沙門菌消毒上的，溫度升高 10 度攝氏，殺菌電力兩或三倍。